Científicos que trabajan en el microbioma intestinal han descubierto y aislado más de 100 especies de bacterias completamente nuevas de los intestinos de personas sanas.
El estudio del Instituto Wellcome Sanger, en Reino Unido, el Instituto Hudson de Investigación Médica, Australia, y el Instituto Europeo de Bioinformática (EMBL, por sus siglas en inglés), en Reino Unido, creó la colección más completa de bacterias intestinales humanas hasta la fecha, lo que ayudará a los investigadores de todo el mundo a analizar cómo nuestro microbioma nos mantiene saludables y su papel en las enfermedades.
En un artículo que se publicó este lunes en Nature Biotechnology, el nuevo recurso permitirá a los científicos detectar qué bacterias están presentes en el intestino humano, con más precisión y más rápido que nunca. Esto también proporcionará la base para desarrollar nuevas formas de tratar enfermedades como trastornos gastrointestinales, infecciones y afecciones inmunitarias.
Alrededor del 2 por ciento del peso corporal de una persona se debe a las bacterias y el microbioma intestinal es un sitio bacteriano importante y un contribuyente esencial para la salud humana.
Los desequilibrios en nuestro microbioma intestinal pueden contribuir a patologías y afecciones complejas como la enfermedad inflamatoria intestinal, las alergias al síndrome del colon irritable y la obesidad.
Sin embargo, como muchas especies de bacterias intestinales son extremadamente difíciles de cultivar en el laboratorio, existe un gran vacío en nuestro conocimiento de ellas.
En este estudio, los investigadores estudiaron muestras fecales de 20 personas del Reino Unido y Canadá, y de ellas, se cultivaron con éxito y se secuenció el ADN de 737 cepas bacterianas individuales. El análisis de estos aislamientos reveló 273 especies bacterianas separadas, incluyendo 173 que nunca habían sido secuenciadas previamente. De estas, 105 especies nunca antes habían sido aisladas.
Una gran base de datos pública de bacterias intestinales
El doctor Samuel Forster, primer autor del artículo del Instituto Wellcome Sanger y el Instituto de Investigación Médica Hudson, Australia, dice: “Este estudio ha llevado a la creación de la base de datos pública más grande y más completa de bacterias intestinales asociadas a la salud humana. El microbioma intestinal juega un papel importante en la salud y la enfermedad. Este importante recurso cambiará fundamentalmente la forma en que los investigadores estudian el microbioma”.
Los métodos estándar para comprender cómo el microbioma intestinal tiene un impacto en la salud humana implica la secuenciación del ADN de muestras mixtas de bacterias intestinales para tratar de comprender cada componente.
Sin embargo, estos estudios se han visto gravemente obstaculizados por la falta de bacterias aisladas individualmente y genomas de referencia de ellos. La nueva colección de cultivos y los genomas de referencia harán que sea más barato y más fácil para los investigadores determinar qué bacterias están presentes en las comunidades de personas e investigar su papel en la enfermedad.
El doctor Rob Finn, autor del Instituto Europeo de Bioinformática de EMBL, explica: “Para los investigadores que intentan descubrir qué especies de bacterias están presentes en el microbioma de una persona, la base de datos de genomas de referencia de aislamientos puros de bacterias intestinales es crucial. Luego, si quieren probar una hipótesis, por ejemplo, que una especie en particular está enriquecida con cierta enfermedad, pueden aislarse de la colección y realizar pruebas físicas en el laboratorio si esta especie parece ser importante”.
“Esta colección de cultivo de bacterias individuales cambiará el juego para la investigación básica y traslacional de microbiomas.
Hemos creado un recurso que hará que el análisis de microbiomas sea más rápido, más barato y más preciso, y permitirá un mayor estudio de su biología y funciones. En última instancia, esto nos llevará a desarrollar nuevos diagnósticos y tratamientos para enfermedades como trastornos gastrointestinales, infecciones y afecciones inmunológicas”, añade el doctor Trevor Lawley, autor principal del Instituto Wellcome Sanger.
Fuente: EP